NCBI在线Blast的图文说明

    Blast(Basic Local Alignment Search Tool)是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具。BLAST程序能迅速与公开数据库进行相似性序列比较。BLAST结果中的得分是对一种对相似性的统计说明。 BLAST 采用一种局部的算法获得两个序列中具有相似性的序列。 Blast中常用的程序介绍: 1、BLASTP是蛋白序列到蛋白库中的一种查询。库中存在的每条已知序列将逐一地同每条所查序列...
    作者:木木 | 分类:网站教程 | 阅读:1824 点击 | 标签:

    BlastN、MegaBlast和Discontiguous MegaBlast三者的比较区分

    它们共同之处就是 BlastN/Megablast/Discontiguous megablast 都是BlastN,就是核酸序列比对核酸序列的算法。 BlastN:应该是出现较早的算法。比对的速度慢,但允许更短序列的比对(如短到7个碱基的序列)。 MEGABLAST:主要用来鉴定一段新的核酸序列,它并不注重比对各个碱基的不同和序列片断的同源性,而只注重被比对序列是否是数据库未收录的,是否为新的提交序列或基因。 速度快。同一...
    作者:木木 | 分类:网站教程 | 阅读:1567 点击 | 标签:,

    BLAST——核酸序列相似性比较的工具

    Blast(Basic Local Alignment Search Tool)是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具。BLAST程序能迅速与公开数据库进行相似性序列比较。BLAST结果中的得分是对一种对相似性的统计说明。 BLAST 采用一种局部的算法获得两个序列中具有相似性的序列。如果您想进一步了解BLAST算法,您可以参考NCBI的BLAST Course ,该页有BLAST算法的介绍。 BLAST的功能 BLAST对一条或多条...
    作者:木木 | 分类:网站教程 | 阅读:1619 点击 | 标签:,

    NCBI的功能及应用方法

    GenBank Overview 基本信息 •    什么是GenBank?GenBank是一个有来自于70,000多种生物的核苷酸序列的数据库。每条纪录都有编码区(CDS)特征的注释,还包括氨基酸的翻译。GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织,包括EMBL和DDBJ。 •    纪录样本 - 关于GenBank的各个字段的详细描述,以及同Entrez搜索字段的交叉索引。 •    访问GenBank - 通过Entrez Nucleotides来查询。...
    作者:木木 | 分类:网站教程 | 阅读:11,062 点击 | 标签:

    NCBI使用教程下载

    NCBI是美国国立卫生院建设的关于生物医学网站,提供文献、基因序列、蛋白序列等的功能性数据库,其Blast分析功能和PubMed文献为广大科研工作者提供了极大的方便。 生物类研究生的常用NCBI使用教程,希望能对大家的科学研究和学习有所帮助。 PDF版本下载地址
    作者:木木 | 分类:网站教程 | 阅读:11,849 点击 | 标签: